คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี กำหนดให้สร้างสถานที่จัดเก็บรวบรวมและจัดแสดงของหอจดหมายเหตุและพิพิธภัณฑ์รามาธิบดีไว้ที่บริเวณงานบริหารทรัพยากรการเรียนรู้ ชั้น ๒ และ หอเกียรติยศ ชั้น ๙ ภายในอาคารเรียนและปฏิบัติการรวมด้านการแพทย์และโรงเรียนพยาบาลรามาธิบดี โดยดำเนินการแล้วเสร็จใน พ.ศ. ๒๕๕๓ แบ่งพื้นที่บริเวณชั้น ๒ เป็น ๘ โซน ดังนี้
โซนที่ ๑ พระบารมีคุ้มเกล้ารามาธิบดี โซนที่ ๒ รามาธิบดี อดีตถึงปัจจุบัน
โซนที่ ๓ เรื่องเล่ารามาธิบดี โซนที่ ๔ อดีต-ปัจจุบัน- อนาคต รามาธิบดี
โซนที่ ๕ บุคลากรรามาธิบดี โซนที่ ๖ วิจัยและตำรารามาธิบดี
โซนที่ ๗ เริ่มต้นที่รามาธิบดี โซนที่ ๘ เจาะลึกรามาธิบดี
สำหรับบริเวณชั้น ๙ ของอาคารเรียนและปฏิบัติการรวมด้านการแพทย์และโรงเรียนพยาบาลรามาธิบดี ได้จัดทำหอเกียรติยศ (Hall of Fame) แสดงประวัติและผลงานของบุคลากรของคณะฯ ที่ได้สร้างชื่อเสียงในด้านต่างๆ
การดำเนินงานข้างต้นได้เสร็จสิ้นตามกำหนดเป็นส่วนใหญ่และได้เปิดให้ผู้สนใจเข้าเยี่ยมชมและสืบค้นข้อมูลในหอจดหมายเหตุและพิพิธภัณฑ์รามาธิบดี ได้ตั้งแต่ เดือน กรกฎาคม พ.ศ. ๒๕๕๓ รวมทั้งได้จัดนิทรรศการเป็นครั้งคราวหมุนเวียนตามโอกาส ได้แก่ “กำเนิดรามาธิบดี” “เอกสารลายมือเขียน: ผู้ก่อตั้งคณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี” “อดีตสู่ปัจจุบัน: รามาธิบดี” “เรื่องเล่าชาวรามาธิบดี: อาคารเรียนและปฏิบัติการรวมด้านการแพทย์และโรงเรียนพยาบาลรามาธิบดี” และ “ของที่ระลึกในโอกาสต่างๆ”