Page 118 - รายงานประจำปี 2563 มหาวิทยาลัยมหิดล คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี
P. 118
116
คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี
มหาวิทยาลัยมหิดล
โครงการถอดรหัสพันธุกรรม SARS-CoV-2 ทั้งจีโนมของสายพันธ์ุที่ระบาดในประเทศไทย
ศูนย์จีโนมทางการแพทย์และกลุ่มพันธมิตร COVID-19 Network Investigations (CONI Alliance) จัดทําา แผนวิจัยการถอดรหัสพันธุกรรมทั้งจีโนมของ SARS- CoV-2 โดยตรงจากสิ่งส่งตรวจไม่ผ่านการ culture เพ่ือให้เหมาะสมกับระยะเวลาและสถานการณ์การระบาด มีวัตถุประสงค์ 1) เพ่ือพัฒนาเทคนิคการเพ่ิมจําานวน สารพันธุกรรม (enrichment) และวิธีการหาลําาดับ นิวคลีโอไทด์ทั้งจีโนม (whole-genome sequencing workflow) สําาหรับเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 โดยตรงจาก สิ่งส่งตรวจ ไม่ต้องผ่านการ culture 2) เพื่อวิเคราะห์ความ หลากหลายของประชากรของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 ท่ี พบในประเทศไทย 3) เพื่อศึกษารูปแบบการแพร่กระจาย ของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 โดยใช้ข้อมูลทางระบาดวิทยา พนั ธศุ าสตร์(genomicepidemiology)เพอื่ สง่ เสรมิ แผนการ ป้องกันและควบคุมโรคร่วมกับข้อมูลทางระบาดวิทยา จากสถาบันป้องกันควบคุมโรคเขตเมือง กรมควบคุมโรค เขต กทม. (สปคม. กทม.) รวมทั้งข้อมูลทางคลินิกจาก
คณะแพทยศาสตร์โรงพยาบาลรามาธิบดี 4) นําานวัตกรรม การถอดรหสั พนั ธกุ รรมเปดิ ใหบ้ รกิ ารใหก้ บั โรงพยาบาลของรฐั และเอกชน โดยมีเป้าหมายเพื่อให้เกิดองค์ความรู้ในการ ควบคุมโรค การนําาวัคซีนมาใช้ในประเทศ การกลายพันธ์ุ การติดเช้ือแฝง การติดเชื้อซํา้า หรือประเมิน/ออกแบบ ชดุ ตรวจทางอณชู วี วทิ ยา serology รวมถงึ การปรบั การใชย้ า ต้านไวรัสในอนาคต
จากการดําาเนินงานโครงการฯ ได้รับความร่วมมือเป็น อย่างดีจากผู้ร่วมวิจัยท้ังในและต่างประเทศ โดยมีการ ถอดรหัสพันธุกรรมท้ังจีโนมเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 ไปแล้ว มากกว่า 275 ตัวอย่าง และสามารถพัฒนานวัตกรรม การตรวจวเิ คราะหก์ ารกลายพนั ธข์ุ องเชอื้ ไวรสั SARS-CoV-2 ด้วยเทคโนโลยี MassArray สามารถรายงานผลสายตระกูล การกลายพันธ์ุ การติดเชื้อแฝง การติดเช้ือซํา้า และซากไวรัส SARS-CoV-2 ได้ภายใน 24 ชั่วโมง
สําาหรับแผนการดําาเนินงานใน ระยะต่อไป คือ ดําาเนินการถอดรหัส พนั ธกุ รรม SARS-CoV-2 ทงั้ จโี นมเปน็ ระยะ เฝ้าดูสายตระกูล ติดตามการ แพร่กระจายของโรค เพื่อเป็นข้อมูล ประกอบการควบคุมโรค และบริการ ตรวจวิเคราะห์การกลายพันธุ์ของเชื้อ ไวรัส SARS-CoV-2 ด้วยเทคโนโลยี MassArray โดยสามารถรายงานผล สายตระกูล และซากไวรัส SARS- CoV-2 ได้ภายใน 24 ชั่วโมง
ภาพที่ 1 การออกแบบ specific PCR primer เพื่อตรวจจับ genomic variant จําานวน 36 ตําาแหน่ง ครอบคลุมสายตระกูลของเชื้อไวรัส SARS-CoV-2 รวม 22 clade
